五族共和，蒙藏乃民族之一，当然无别立官署之必要。徒以俗尚不同，封爵未除，故其事项，不能隶之各部署，一也。自入民国，外蒙首先独立，经几多之劝导，始改自治，而内蒙如廓尔罗斯诸旗，亦时有蠢动。西藏则自达赖私归后，意在为虎作伥，窥伺川边，征防化导事以日烦，二也。蒙古王公在京者，无所事事，而其中尽有明达事理，声势足号召蒙人之材，势不得不设此院以处之三也。
其组织法，设总裁副总裁各一人、参事二人、司长二人、秘书二人、佥事十二人、主事二十四人、编纂翻译十四人，总务厅辖七科。第一第二两司，各辖三科，外有秘书室，任总裁者，以贡桑乐亭为最久。其人明敏英锐，敢任事。当陶克陶煽惑内蒙之日，颇赖其维持防制之力。第轻佻好冶游，故蒙藏院官吏，相习成风，大半称嫖界巨子焉。
旗籍荣某，本成都将军恭寿子，荣禄之侄婿，项城之旧交也，遂被任为副总裁，院章总裁主持大计。若本院事务，绵副者管理，荣固擅综核，颇撙节小费。属官衔之刺骨，报纸亦频有讥诋，然项项信之专，无如何也。恭寿在日，曾权川督，司阍者张姓，索贿得十余万金以归。庚子以贱价收屯京官宅邸卖品，因以益富。后启照相馆于京师，民国划锄阶级制度，遂希冀入仕籍，而经营蒙藏院会计尤力。
荣以乃父因张，不得良死（恭寿以参案吞金自尽死）。拒之甚坚。张愧愤，乃串通雇员，捏造条件，谓荣中饱院款五万余，刊为传单，散之众人。适院员方恶荣甚，遂拟集合呈诉，幸参事某有识力为解释，事始得寝，而荣终不安其位焉。
江南某君，以拔贡服官北洋，后入陆军部，尝权侍郎，少少读李若农何愿船诸人著作，遂自谓谙习蒙事，数条陈边务，复刊书以贻人。因是得微名。入民国，遂跻口北宣抚使，蒙藏院副总裁。其口北之行，凡蒙古台吉王公少富者，莫向之借贷，因获重金以归，素为驻京蒙员所鄙弃。
袁氏闻之，笑谓某服官多年，何由不改招摇行径。副总裁位遂不保。闻其在院日，频设宴宴蒙古王公，而每宴必有请托，众皆苦之，尝为那彦图所面诋，不以为赧也。又其私寓陈设，亦以责之庶务科，科员某皖人，故意为铺张，地毯壁镜，铜床檀椅，并摹西式，且与约曰：“购物至苟合公意，乞签字发票上，科中即照付资。”
某以利昏忽忽许之，逾时是科员手其签字发票来谒，谓算结实欠五千元，乞立付免。下吏为难，某大错愕然又无词拒绝。后赖某司长调停，始允陆续归结，而见者谓诸物实不值三千元也。自是始不敢责庶务科供应，今其人无聊甚，骗得东海万金，南下组织政党。不逾日，以内阁改组，党中多流氓过门者，皆唾弃不顾云。
鄂人某甲者，夙肆业自强学堂，为梁星海得意弟子，亦略读朔方备乘诸书。自负边才，蒙藏院成立，即任为参事。是时院权皆操其手，遂壹意援引私谊，又倩其乡人能文者，拟为条议，上之袁氏，素服其才，数传见咨询边事。蒙古王公，以其得主峰欢，多与论交。
甲亦挥霍，应酬周至，自是望日隆，遂擢为边地都护使。办事大员，尝闻佥事某君言，甲腹俭而喜猎文誉，蒙古贵人之喜吟咏者，多与唱和，又时流览佛书，多记梵典，以资谈助。编纂科编纂蒙藏回图籍成，甲欲矜淹博，颇有涂改，编纂员愤而与争。甲笑谢乃已。
册封祭奠，凡奉使至蒙者，例得厚馈。清代乃乾清门侍卫差使，民国属之蒙藏院，院员奉差自口外归者，他不具论，必有良马数骑，以壮行色。京师市上，乘骡车而顶跟马并矫健者，必蒙藏院官吏也。曩者理藩院司员，于台吉王公承袭册封事，索贿必饱欲壑始已。民国初亦欲沿故习，而外蒙已叛，内蒙势亦岌岌，袁氏专主怀柔，频戒诸司，于蒙事勿留难。故至今皆随意酬劳，不取定价婪取也。
当袁氏谋僭帝号，频优赉蒙王等，诱之劝进。是时院员亦大有生色，司长某谓新君践阼，蒙回翌戴，实本院运筹之力。今蒙回王公，已晋封加俸，院员未便向隅，开单呈总裁请奖，而所拟则两司长、两参事，均封男爵也。闻者皆笑至失声。
蒙回各旗，有被匪被灾者，例须抚恤，其数目则由院拟定，咨呈国务院，转财政部照发。然损失情形轻重，则当据各办事长官等呈报，而核稿者，则第一司民治科员也。有某旗章京，以被匪抢掠，呈请抚恤，原呈损失约五千元，乃议给恤费三千元，而定章按照损失价值三分之一给恤，是此数计多出一千余元，则以科员与该旗章京有连也。后为司长所核驳，始以笔误了事，盖起稿时，数目字竟填小数也。